恢复建立健全的良种繁育体系是防止种性退化的基础。鉴于红麻种子主要依赖于南种北调的特殊性，北方麻区与南方麻区农业部门必须相互配合，在科研部门的支持下，首先恢复建立健全的红麻良种繁育体系。第一，必须建立红麻种子繁育资格许可制度，只有在具备相关的红麻良种繁育技术人员，稳定的良种繁育基地，必要的种子贮藏设备，才可进行红麻种子繁育。第二，严格实行红麻种子繁育的区域化，实行一地一种。第三，按计划、定单繁种，北方麻区应在年初初步确定种子需求量、品种类型，并与南方繁种基地签订需求协议，南方基地则按定单繁种，保证红麻种子供需基本平衡，市场相对稳定。良繁基地必须实行品种统一，繁种原种供应统一，种子收购统一，销售统一，种子管理部门应加强红麻种子市场管理，杜绝红麻种子的乱繁乱引，以次充好现象。育种研究单位应及时将种性稳定的优良红麻新品种提供给繁种基地，以加快品种更新换代。      

配套的红麻良种繁育技术是防止红麻种性退化的保证。红麻由于异花授粉率较高，种植保纯比较困难，良种繁育技术要求较高，必须在专业技术人员指导下进行。首先必须严格实行一地一种或品种间远距离隔离，防止昆虫传粉。其次是定期提纯、去劣去杂，将具有原品种典型性状的植株保留，而杂、劣株在开花前必须全部拔除。红麻杂种优势非常显著，但红麻杂交种子制种目前还是以化学杀雄，人工授粉方法进行。制种成本较大，目前全国仅有中国农业科学院麻类研究所在海南每年能生产一定量的杂交种子。因此，各繁种基地一般目前自制杂交红麻种子的条件还不成熟。红麻品种种性退化，市场混乱的局面已持续了很长时间，无论南方还是北方麻农均深受其害。但只要各地政府其农业部门真正引起重视，严格按种子法办事，针对红麻种性的特殊性，健全繁种体系，提高繁育技术，南北协调，齐抓共管，认真规范红麻种子市场，红麻品种种性退化的现象就可能防止。